【Q】5m(200in)を超えるPDFは作れるのか
【A】作れます。
ただしPDFの規格としては規格外
PDF 32000-1:2008の規格では以下のような記載があります
-----ここから引用
The minimum page size should be 3 by 3 units in default user space; the maximum should be 14,400 by 14,400 units. In versions of PDF earlier than 1.6, the size of the default user space unit was fixed at 1⁄72 inch, yielding a minimum of approximately 0.04 by 0.04 inch and a maximum of 200 by 200 inches. Beginning with PDF 1.6, the size of the unit may be set on a page-by-page basis; the default remains at 1/72 inch.
-----ここまで引用
規格としては
解像度72dpiで200インチ（約5m）までとなります
そのため、AcrobatReader等では5Mを超えるPDFは200インチ内に収まるサイズとして
表示されるようです。
ただし、PDF作成ソフトや表示ソフトによっては
規格に対しての組み込み方法が異なる物もありますので
アップルのプレビュー等では以下のような５Mを超えるPDFを作る事が出来ます
72ppiで作成していますので
幅で
イメージサイズとメディアボックスが
21600÷72で300インチ（7.62mの幅）のPDFを作成できていますね
厳密には規格外ですが
質問者の環境はわかりませんが
作成出来るソフトウェアがあると思います。
Adobe Community: 5ｍ以上のスキャン画像をＰＤＦ変換できない
http://forums.adobe.com/message/6260013
に
答えてみました